A raiz do IIRC é raiz onde você está logando, seja o CD, outra instalação ou qualquer outra coisa.
Se você estiver com problemas, no CD, basta carregar uma instância raiz do nautilus (Alt + F2, gksu nautilus
) e continuar.
Se o seu sistema de arquivos sofreu algum dano, poderá ser montado em modo somente leitura. Se você está tentando mover as coisas, isso não vai funcionar. Então, para os propósitos do seu backup, tente apenas copiar as coisas.