Eu uso o mesmo dispositivo USB no meu Ubuntu e no meu PC com Windows. Normalmente, os vírus do Windows não podem afetar o seu sistema operacional Ubuntu, porque os vírus que afetam o seu PC com Windows são escritos para o Windows e não funcionam em um sistema operacional Linux, como o Ubuntu.
No entanto, o Ubuntu está ficando mais popular e, portanto, pode se tornar mais lucrativo escrever vírus para o Ubuntu. Muitas pessoas afirmam que você não deve se preocupar com vírus no Ubuntu, mas mesmo assim, não faz mal instalar programas antivírus escritos para o Ubuntu. ClamAV é aquele que é atualizado regularmente. Você pode encontrar uma versão antiga dele no repositório de software do Ubuntu que você pode encontrar na sua fita, mas eu recomendo que você instale a última versão que você pode encontrar no site do ClamAV. Ele vem com instruções e um arquivo leia-me.