Sim, tanto o Ubuntu quanto o Xubuntu usam o mesmo repositório. Assim, você pode instalar e usar aplicativos gnome como o gnome-terminal no Xubuntu. Mas lembre-se, você não pode usar o gnome-session no Xubuntu.
Eu mesmo usei o Xubuntu com aplicativos gnome ou Ubuntu, como gnome-terminal, gedit, etc. Tudo bem, a menos que você tenha tentado executar as sessões do gnome ou do Ubuntu no topo da sessão do Xubuntu.
Comentário do OP:
Então, eu posso até criar programas usando o GTK, certo? Usando Anjuta ou gEdit + GCC
Sim, claro. Contanto que você tenha instalado as bibliotecas gtk e as ferramentas de desenvolvimento necessárias.