Você pode instalar o MonoDevelop 3.0.x (estável) por meio de este PPA .
sudo apt-add-repository ppa:directhex/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install monodevelop
Por favor, note que o Monodevelop 3.0 será incluído no Quantal 12.10.
Observação: se você não estiver familiarizado com a instalação de softwares de terceiros de PPAs, consulte estas perguntas: