Eu notarei que Mark Shuttleworth me fez essa pergunta sobre um ano atrás, quando o Unity foi compartilhado pela primeira vez conosco.
O vinho não pode usar o menu global e, provavelmente, nunca o fará. A razão é que o menu global da Unity requer reescrita de cada kit de ferramentas de janelas (GTK, por exemplo) - é por isso que alguns aplicativos como o LibreOffice ainda não usam o menu global: eles foram escritos com kits de ferramentas que a Unity ainda não suporte.
Para fazer o menu global funcionar no Wine, seria necessário uma reescrita ainda mais invasiva do próprio Wine - o Wine não está apenas implementando os toolkits gráficos do Windows, mas também deve atuar como um gerenciador de janelas. Os aplicativos do Windows não têm quase nenhum escrúpulo em fazer coisas muito estranhas, e provavelmente muitos aplicativos quebrariam de formas bizarras se seus menus fossem movidos ou funcionassem de maneira um pouco diferente.