Existem maneiras melhores de proteger arquivos confidenciais. Qualquer pessoa com algum conhecimento básico de linux pode encontrar e ler arquivos ocultos.
Sugiro que você crie um diretório criptografado ou uma partição criptografada e armazene seus dados confidenciais lá. Você pode fazer isso manualmente.
Talvez a melhor alternativa seja instalar uma nova versão do Ubuntu e usar o 'LVM com criptografia' alias 'encrypted disk', que é uma alternativa automática na página de particionamento do instalador.
O link a seguir pode ajudar você com essa instalação,
Instale (disco inteiro com lvm e criptografia) no Ubuntu Desktop amd64 em Xenial 16.04.4