Isso acontece esporadicamente e eu ainda não percebi nada que esteja consistentemente correlacionado com esse problema (o que, percebo, dificulta a replicação e / ou o diagnóstico), mas muitas vezes durante o último mês, ao selecionar um novo diretório da barra lateral de uma janela nautilus já aberta, o conteúdo do diretório anterior permanece exibido. Clicando novamente no diretório desejado, ou tentando escolher outro diretório da barra lateral, falha em fazer qualquer coisa na lista de conteúdos que o nautilus já estava exibindo.
Eu posso, como um trabalho, clicar com o botão direito no diretório e abri-lo (com sucesso) em uma nova aba.
Vale notar que a janela não está 'congelada' - o diretório recém-selecionado fica realçado na barra lateral, e outros recursos da janela são totalmente funcionais, mas a listagem do diretório permanece inalterada.