Eu sou novo no UBUNTU e no Mothur. Estou tentando instalar a versão 39,5 Mothur que baixei do link (Mothur.linux_64.zip). Eu segui o pipeline de instalação fornecido por Mothur:
mkdir mothur
cd mothur
unzip ../Mothur.source.zip
make
Mas recebo este erro:
make: *** No targets specified and no makefile found. Stop.
Eu fui para os arquivos e não consigo encontrar nenhum makefiles (Blast, CatchAllCmdL.exe, LICENÇA, mothur, uchime, vsearch. Eu poderia tentar usar:
Sudo apt install mothur
mas instala apenas a versão anterior. Se alguém puder dar uma ajuda com isso!.
Obrigado
Você não precisa criar mothur da fonte.
Mothur.linux_64.zip está pronto para ser executado.
$ wget https://github.com/mothur/mothur/releases/download/v1.39.5/Mothur.linux_64.zip
$ unzip Mothur.linux_64.zip
$ cd mothur
$ ./mothur
dá isto:
mothur v.1.39.5
Last updated: 3/20/2017
[...]
mothur >
Mothur.linux_64.zip contém um executável que já está compilado. Você não precisa construí-lo; você pode apenas executá-lo. Se você tiver cd ed para o diretório mothur descompactado que contém o arquivo que também é chamado mothur , você pode simplesmente executar o comando:
./mothur
Você pode querer descompactar o diretório mothur (ou mover o diretório descompactado) para onde desejar, em seguida, colocar um link simbólico para esse executável mothur em algum lugar no seu PATH .
Se você conseguir executar o programa, mas quiser obter informações sobre como usá-lo, poderá digitar help() no prompt fornecido, que lista todos os comandos disponíveis, bem como links para documentação.
Se você realmente quiser compilá-lo a partir do código fonte então você terá que baixar o código-fonte, que pim diz que você pode fazer obtendo o arquivo .tar.gz rotulado" Código-fonte "em a página de download . Mas com base no que você pediu, não tenho motivos para pensar que você realmente precisa ou quer isso. Com o que você tem, você deve ser capaz de executar o programa; já está compilado para você, então você não precisa compilá-lo primeiro.