Como eu sabia que usar apt-get install youtube-dl instalou um manual de trabalho, reinstalei usando apt-get , copiei o manual /usr/share/man/man1/youtube-dl.1.gz e coloquei em /usr/local/share/man/man1/ . Então eu fiz apt-get remove youtube-dl . Agora, o mais novo programa youtube-dl que eu instalei usando wget está se referindo à antiga página de manual que eu tirei da versão apt-get (que agora é removida). A formatação também está correta.
Provavelmente não é a melhor maneira de fazer isso e a documentação provavelmente está desatualizada. Mas para as opções básicas, vai fazer por agora.