A Microsoft tem um conjunto de instruções e vincula seu PPA ao link para instalar o MSSQL em um sistema Ubuntu.
As instruções não funcionam tão bem com o 17.04, mas não tiveram problemas com o 16.04 (instalei-o em 3 servidores no escritório).
Atualização:
Sim, o terminal não é o mais fácil de se conhecer. Fique com ele, quanto mais você usá-lo - mais fácil fica.
Eu usei alguns editores no Ubuntu para conectar com bancos de dados MSSQL que são fáceis de instalar. Atom.io é um editor geralmente útil com uma boa seleção de pacotes SQL disponíveis para instalação. O código do Visual Code da Microsoft também possui algumas extensões úteis de conexão SQL e de consulta.
HTH