Não, não é. O Windows Installer usa isso para armazenar arquivos de instalação em cache para qualquer coisa instalada na máquina usando o Windows Installer. No mínimo, você pode perder a capacidade de adicionar ou remover programas. Na pior das hipóteses, pode perder a capacidade de executar alguns programas.
Como o Windows Update também pode implantar patches do Windows Installer, você também pode impedir que o seu computador receba atualizações do Windows e do Office.