(Eu só estou tentando melhorar um pouco a resposta marcada, mas com um pouco mais do que eu acho funciona em um comentário simples. Eu achei que seria útil pelo menos postar para o próximo cara. Se um moderador discordar dessa resposta poderia ser rebaixado a um comentário sobre a resposta selecionada, se mais apropriado.)
A referência a pavucontrol foi bastante enigmática e essa resposta foi um pouco menos útil para mim, mas me colocou em uma solução.
Eu não tive nenhum dos problemas de permissão e propriedade que parecem ser o foco principal aqui. O pavucontrol , que tive de instalar apenas para este fim, permitiu-me, no separador de reprodução, mudar de "Estéreo Digital de Controlador de Áudio de Alta Definição (HDMI)" para "Estéreo Analógico de Áudio Incorporado "e meu áudio começou a funcionar novamente como antes .
Eu ainda não sei que peguei meu ThinkPad (rodando o Mint 13 que é basicamente o Ubuntu 12.04 LTS) neste estado não funcional, mas foi assim que consegui fazer o áudio (em particular, o Audacious Player usando Pulse) funcionar. Espero que isso ajude.