'S' = O bit setgid do diretório está definido, mas o bit de execução não está definido.
's' = O bit setgid do diretório está definido e o bit de execução está definido.
SetGID = Quando outro usuário cria um arquivo ou diretório sob um diretório setgid, o novo arquivo ou diretório terá seu grupo configurado como o grupo do proprietário do diretório, em vez do grupo do usuário que o cria.
Para remover o bit setGID:
chmod g-s eclipse/
Retirado do homem chmod:
You can set or clear the bits with symbolic modes like u+s and g-s, and you can set (but not clear) the bits with a numeric mode.
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