Você pode conferir a opção "Reduzir" em Configurações > Preferências > Geral > Barra de abas (seção).
No Notepad ++ (6.5), a configuração de tamanho dos rótulos de guias fica em Configurações > Preferências > Tab Settings, embora isso pareça ser uma configuração para formatação em documentos.
Espero que uma dessas configurações ajude.