Sim, você pode ter endereços IPv4 e IPv6 associados ao mesmo nome de DNS.
Como regra geral, os serviços devem ser disponibilizados tanto no ipv4 quanto no ipv6 e o mesmo nome DNS voltado ao público usado para ambos. Dessa forma, tanto os clientes somente IPv4 (ainda muito comuns) quanto os clientes somente IPv6 (não muito comuns ainda) poderão acessá-lo usando o mesmo nome. Em geral, os clientes dual stack testarão o IPv6 antes de voltar ao IPv4, embora não exista uma regra rígida e rápida.
Geralmente, é útil ter nomes de DNS adicionais que ofereçam apenas um protocolo, para que você possa testar se o servidor funciona corretamente em ambos os protocolos, mas esses nomes geralmente não devem ser promovidos aos usuários.
Se você oferecer apenas IPv4, praticamente todos poderão acessar seu site, mas à medida que a crise IPv4 morde, uma proporção cada vez maior de usuários se conectará por meio de alguma forma de serviço NAT de nível ISP (seja NAT v4 convencional, NAT64 ou ds-lite). Os serviços NAT no nível do ISP tornam o rastreamento / bloqueio / denúncia de abuso muito mais difícil.
Se você oferecer apenas IPv6, uma proporção substancial de usuários não poderá acessar seu servidor.