No Windows : C:\Users\<username>\AppData\Local\Google\Chrome\User Data\
Dentro desta pasta existe uma pasta Temp, vários arquivos globais e, em seguida, uma pasta para cada perfil. A maioria das configurações é específica do perfil, então você provavelmente desejará procurar lá.
Há provavelmente apenas um perfil, "Padrão". Se você excluí-lo, perderá todas as suas configurações, histórico, cookies, senhas salvas, favoritos, extensões, etc. O Google Chrome simplesmente o recriará na próxima vez que você executá-lo, no entanto.
No OS X : ~/Library/Application Support/Google/Chrome/
No Linux : ~/.config/google-chrome/