Infelizmente, você não pode fazer isso. O hardware é abstraído de aplicativos e até mesmo partes do sistema operacional. Em essência, o aplicativo diz "gravar isso no disco" e o sistema operacional lida com isso. O aplicativo não manipula como ou quando é gravado. Tudo isso é feito no nível do driver e do kernel e não há uma maneira real de alterar isso.
Mesmo se você pudesse fazer isso, o fato é que você está usando um disco magnético giratório - e um muito lento - você não veria muito ganho . A unidade está constantemente girando e as cabeças estão se movendo ao longo do disco. Mesmo que você escreva menos para o seu arquivo, o disco estará constantemente buscando as áreas certas no disco para ler / gravar de / para.
A sua melhor opção seria obter outra unidade e fazer o seu trabalho nessa unidade, deixando a sua primeira unidade para a sua internet, MP3s, etc.
P.S. Você não mencionou a quantidade de memória RAM que você tem. A troca pode ser um fator na baixa velocidade. Dependendo da quantidade de memória RAM que você tem, adicionar mais só ajudará.