Se os dois servidores forem pares de NTP, use
ntpq -p
Que mostrará as compensações atuais
Observe que o NTP leva em conta a latência da rede. Se você conhece o deslocamento de cada servidor de um servidor NTP comum, isso é o mais preciso que você pode obter usando ferramentas padrão.
UPDATE
Eu tenho dois servidores unix usando o NTP. Vamos ver que tipo de tempo eles estão mantendo:
$ sudo /usr/sbin/ntpq -p
remote refid st t when poll reach delay offset jitter
==============================================================================
hufu.ki.iif.hu 185.219.2.214 2 u 12 64 1 71.755 -0.073 0.001
web.puflet.info 188.138.107.156 3 u 11 64 1 78.248 0.417 0.001
84.2.44.19 10.20.75.140 2 u 10 64 1 74.721 -1.076 0.001
$ sudo /usr/sbin/ntpq -p otherbox
remote refid st t when poll reach delay offset jitter
==============================================================================
+ntp2.exa-networ 195.66.241.10 2 u 799 1024 377 43.405 7.796 218.471
+mantaray.netine 249.240.53.144 3 u 289 1024 377 34.782 8.484 212.631
*rilynn.me.uk 81.2.117.228 2 u 765 1024 377 45.665 6.804 142.023
+ntp.thirdlight. 193.67.79.202 2 u 791 1024 377 38.322 9.871 223.397
Eles estão usando servidores diferentes porque usam servidores do pool ntp.
Adicionarei temporariamente otherbox à configuração deste servidor para poder medir diretamente o deslocamento de tempo
$ sudo vi /etc/ntp.conf
(added 'server otherbox')
$ sudo /sbin/service ntpd restart
$ sudo /usr/sbin/ntpq -p
remote refid st t when poll reach delay offset jitter
==============================================================================
gamma.h3x.no 78.70.33.22 3 u 4 64 1 34.840 -0.964 0.001
web.puflet.info 188.138.107.156 3 u 3 64 1 78.148 -1.243 0.001
alpha.rueckgr.a 129.69.1.153 2 u 2 64 1 61.495 -2.362 0.001
otherbox.exampl 60.155.73.34 3 u 1 64 1 0.604 -11.286 0.001
Parece que os timestamps nos meus dois servidores são de cerca de 11 ms diferentes.