É provável que seja uma janela "oculta" de um aplicativo mal escrito. Para descobrir a qual processo ele pertence, faça o download do Process Explorer , uma excelente ferramenta de diagnóstico da Sysinternals.
Execute o programa e aceite o EULA, não é necessária instalação. Na barra de ferramentas, há um ícone que se parece com um destino, intitulado "Localizar processo da janela". Clique e arraste desse ícone para a região cinza. Quando você soltar o mouse, o Process Explorer realçará o processo que possui a janela.
As colunas Descrição e Nome da Empresa podem ajudar a identificar o aplicativo responsável ou você pode procurar na Internet pelo nome do processo. Clicar duas vezes na linha produz informações interessantes adicionais.