Isso realmente depende da sua placa-mãe - não há padronização sobre o que as cores significam para as portas SATA em placas-mãe diferentes. Você terá que consultar o manual que acompanha sua placa-mãe para uma identificação mais clara.
Geralmente, portas SATA em uma placa-mãe com cores diferentes podem ser categorizadas como:
- Portas do controlador SATA principal
- Portas do controlador SATA compatíveis com RAID
- Portas secundárias do controlador SATA
Normalmente, a cor que possui mais portas são as portas do controlador SATA principal (geralmente preto). A cor que tem o mesmo número de portas (geralmente 2) é compatível com RAID (se sua placa-mãe suporta, e eu vi amarelo e vermelho), e as portas secundárias do controlador SATA são geralmente vermelhas.
Alguns fabricantes podem até mesmo colorir as portas apenas para ajudar o usuário a identificar quais portas usar para um suporte eSATA.
Espero que isso ajude. Se você nos dissesse o modelo da sua placa-mãe, provavelmente poderíamos identificá-los para você.
EDIT: Encontrou o esquema de layout da porta para o seu M2A-VM.
Você tem apenas 4 portas SATA na sua M2A-VM. 2 estão marcados a preto, 2 estão marcados a vermelho. Não há distinção no utilitário para todas as 4 portas, as portas SATA pretas são portas 1 & 2 e portas SATA vermelhas são portas 3 e amp; 4. Basta ir em série a partir da porta 1. Ele não afeta nada.
Link para o manual da sua motherboard aqui (Link para PDF).