A questão principal é: você tem uma partição /home separada?
Se sim, apague o / e deixe /home intacto, apenas defina o ponto de montagem para ele.
Se não e houver alguns arquivos importantes, recomendo que você monte sua partição e remova tudo, exceto /home , por exemplo
fdisk -l
Examine a saída e encontre o nome do dispositivo apropriado
mount /dev/sdaXY /mnt # use the device name from fdisk -l here
mkdir /mnt/2rm # create working dir
mv /mnt/* /mnt/2rm # move all dirs to work dir
mv /mnt/2rm/home /mnt # return home back
rm -rfv /mnt/2rm # now we can safely delete the rest
Após as manipulações acima, você pode facilmente instalar o Ubuntu na mesma partição. O Ubiquity, o instalador do Ubuntu, irá preservar o seu diretório /home .