O URL inteiro será criptografado. Quando o navegador da Web se conecta ao servidor, ele se conecta ao endereço IP apropriado, inicia a criptografia e envia a solicitação (nome do host, URL, parâmetros, conteúdo do formulário, etc.).
Note que a pesquisa de DNS não será criptografada, para que qualquer pessoa que olhe para o seu tráfego saiba que você procurou o domínio, mesmo que ele não saiba o que você enviou ou o que retornou. Isso pode ou não ser importante no seu caso.