No Banshee, escolha Editar > Preferências do menu no topo. Na guia Geral da janela de diálogo Preferências, deve haver uma opção chamada "Sincronizar metadados entre biblioteca e arquivos". Certifique-se de que esta opção esteja marcada.
Até onde eu sei, essa opção não atualizará retroativamente os metadados dos arquivos que você atualizou anteriormente no Banshee, mas gravará metadados nos arquivos para futuras atualizações que você fizer.