Mesmo que você não esteja usando o Internet Explorer para navegar na Internet, você definitivamente deve mantê-lo atualizado. Eu não diria que você tenha para atualizar para a versão principal mais recente, mas pelo menos instale os patches de segurança para a versão que está sendo executada, até que não seja mais suportado e atualize para uma versão mais recente. Eu sou um usuário do Chrome, mas há algumas coisas que funcionam melhor com o IE. Pessoalmente, eu sempre mantenho o IE na versão mais recente.
O Internet Explorer é mais do que apenas um navegador. Para o bem ou para o mal, o Internet Explorer está conectado ao sistema operacional de várias maneiras. Programas chamados HTA s, que o SO usa para uma variedade de interfaces, exigem que o Internet Explorer funcione. Alguns programas escritos com o Visual Studio podem usar o IE para navegação e ajuda internas. Existem muitas outras funções que o IE fornece para outras partes do sistema operacional e aplicativos. Portanto, é definitivamente a melhor prática, no mínimo, mantê-lo atualizado.