Se você estiver executando o compiz, esta é uma mudança bastante fácil de fazer. Primeiro você precisa instalar o Gerenciador de Configurações Compizconfig. Ele aparecerá no seu menu de preferências.
Agora, o que você deseja alterar está no plug-in de animações. Escolha fechar animação e adicionar um novo valor, com fade como a animação (e digite = Tooltip for window match), e adicione a duração da alteração e, em seguida, altere os valores como desejar (eles estão em milissegundos). Eles são aplicados automaticamente.
Com alguns ajustes, você pode ter dicas de ferramentas que parecem durar na tela por um longo período de tempo, ou dicas de ferramentas que desaparecem imediatamente quando você move o mouse. A principal desvantagem é que, com esse método, suas dicas desaparecerão de alguma forma. Você pode fazê-los durar ainda mais, adicionando uma animação aberta com opções semelhantes.