Da coleção de ferramentas que você mencionou em sua lista, eu apenas usei o sound-juicer para o CD Audio Ripping e não experimentei nenhum issueas. No entanto, eu também uso (não tão frequentemente) alguns aplicativos do KDE, rodando nativamente no meu ambiente gnome sem problemas e fazendo um ótimo trabalho. Dos quais eu sugiro que você tente:
Capturas de tela adicionais no site oficial.
Imagens adicionais aqui
Talvez estes não se encaixem em todos os seus requisitos, mas ainda vale a pena tentar. A lista pode ser longa se você procurar alternativas para todos os softwares que você testou e os dois que eu forneci aqui. E tenho certeza que você encontrará boas alternativas que atenderão a todas as suas necessidades em breve.
Boa sorte!