Para o Firefox, existe o Auto Save Document addon que pode armazenar o documento exibido atualmente em um diretório separado automaticamente ao navegar em um determinado site. Infelizmente, tem algumas limitações. Os documentos são armazenados apenas como texto html (sem objetos incorporados, como imagens, etc.) e há um limite de 100 páginas. Então não tenho certeza se pode atender às suas necessidades.
Outro addon do Firefox é Leia mais tarde . Pode salvar páginas em uma lista de leitura com apenas um clique. Não é totalmente automático, então você precisa clicar na pequena seta ao lado da barra de localização sempre que quiser salvar uma página.