Tenho bastante experiência em alternar entre inicializar uma partição do Windows nativamente e executá-la como uma VM. Primeiro de tudo, suporte a hardware e driver não era um problema para mim, nem era necessário desinstalar o VMware Tools ao inicializar em um contexto físico.
Além disso, parece uma ótima ideia, mas ativação do produto é onde ela realmente cai. Não se deve ter que reativar o Windows a cada hora que o Windows alterna entre P e V, mas não é infalível. O Windows e o Office ocasionalmente solicitarão que sejam reativados devido a alegadas alterações no hardware. Uma vez, depois de alternar entre os modos físico e virtual, minha instalação devidamente licenciada do Windows 7 se desativou com um pouco de fanfarra devido a uma suposta "exploração de ativação". Esses problemas seriam evitados, ou pelo menos tornados triviais, se ocorressem em um ambiente KMS .
Quando atualizei para um SSD de 300 GB, eu trouxe minha partição do Windows como um VMDK e nunca mais inicializei nativamente. O Windows 7 parece ter um desempenho melhor virtualizado em um SSD do que nativamente em um HDD, e a imagem esparsa que eu uso agora consome menos espaço em disco do que a partição antiga.
Sumário Executivo: Sim, isso pode ser feito; os drivers são um problema menor do que o esperado, e a ativação do Windows é um problema maior do que o esperado. Se você realmente não precisa executar o Windows no bare metal, sugiro converter sua partição para um VHD ou VMDK e executá-la apenas como uma VM.