Sim, o roteador só permitirá que as máquinas conectadas a ele funcionem a 100 Mbps. Portanto, não, eles não poderão se comunicar em velocidades de gigabit quando conectados apenas ao roteador.
No entanto, desde que você tenha um switch gigabit. Conecte todas as máquinas ao switch e, em seguida, execute o uplink do switch para o roteador. A porta usada como o uplink se conectará ao roteador a 100 Mbps, e o restante das portas no comutador funcionará a 1000 Mbps. Eu tenho essa configuração exata. Todas as máquinas podem se comunicar em velocidades de gigabit no switch e seu roteador 10/100 ainda pode ser usado para internet / wireless / etc.