Existe uma opção "usar teclado numérico como mouse" para o kde e o gnome. No kde 4.4 está localizado sob as configurações do sistema - > Mouse - > Navegação do mouse. Eu acho que está sob as configurações de acessibilidade no gnome. As ações de clique aparecem nas teclas em torno do numpad - a tecla "+" é clique direito e a tecla "5" é deixada no kde.
Se você não executar o kde / gnome ou quiser usar uma solução mais configurável, algum tipo de combinação desses dois programas deverá funcionar:
Use xbindkeys para vincular um pressionamento de tecla a
echo "click 3" | xdo
para obter um clique com o botão direito.