Infelizmente, isso é um bug, então não há muito o que fazer sobre isso, além de preencher um relatório de bug. Mas, você pode ativar o seletor Super (Window Key) + Tab que faz a mesma coisa, alterna entre aplicativos. Eu vou te mostrar como habilitar o switcher Super Key + Tab no Ubuntu 11.10.
1. Abra o Ubuntu Software Center.
2. Na caixa de pesquisa, no canto superior direito, digite "Compiz Config Settings Manager". Clique no resultado do programa e depois clique em instalar.
3. Digite sua senha quando solicitado e pressione Enter.
4. Quando o aplicativo terminar a instalação, abra-o pressionando a tecla Super, procurando por "Gerenciador de configurações do Compiz" e clicando no resultado do programa. Você verá uma janela como a seguinte:
5. Clique em "Ring Switcher", clique em marcar a caixa de seleção para ativar o plugin. Feche o CCSM e pressione Super + Tab.
6. Divirta-se com o seu novo switcher!