Isso soa como um problema de permissão. Certifique-se de que cada diretório e diretório pai que o Apache deve acessar (ambos em / var / www e nos diretórios de destino dos links simbólicos) tenha o bit de execução global definido.
Por exemplo, se os seus links simbólicos apontarem para / home / somebody / www, faça o seguinte:
sudo chmod a+x /var /var/www /home /home/somebody /home/somebody/www
É não necessário para definir o acesso de leitura em qualquer diretório; somente os arquivos que o Apache deve ler devem ter permissões de leitura apropriadas.