As postagens que recomendam a edição /usr/share/gnome-shell/theme/gnome-shell.css estão corretas; no entanto, deve-se notar que, se você estiver usando um tema alternativo do gnome-shell (por exemplo, você está executando o Linux Mint), pode haver arquivos editáveis adicionais.
Por exemplo, o tema 'Mint-Z' de Mint12 tem arquivos .css configuráveis em /usr/share/themes/Mint-Z .
Além disso, as extensões do gnome-shell podem ter seus próprios arquivos .css configuráveis, localizados em /usr/share/gnome-shell/extensions/{extension id}/ ou $HOME/.local/share/gnome-shell/extensions/{extension id}/ . Não tenho certeza se essas configurações podem substituir os padrões do tema.
EDITAR:
@Guilherme realmente responde sua pergunta.
FYI No meu sistema ( gnome-shell 3.2.1-0ubuntu1 ), o seletor css apropriado está localizado em /usr/share/gnome-shell/theme/gnome-shell.css , na linha 720, e está definido como 7.5pt . A configuração real do meu sistema Mint12, no entanto, está em /usr/share/themes/Mint-Z/gnome-shell.css , @line 880 e está definida como 8pt . Modifique esse valor e recarregue seu tema usando o comando 'rt' no prompt ALT+F2 .