Além das formas embutidas de percorrer as janelas, há um utilitário shareware chamado Witch que é como o Comando + Tab em esteróides. (Você pode facilmente remapear atalhos de teclado para que o Witch use o Comando + Tab , também.)
O site para o software está aqui (completo com uma captura de tela muito interessante).
O programa custa 10 euros para se registrar, mas parece funcionar por um longo tempo sem registro - eu finalmente o fiz depois de vários meses de uso.
Altamente recomendado, especialmente para alguém como eu que veio do mundo Windows recentemente e para quem a maneira nativa do Mac de trocar janelas não combinava muito com meus hábitos.