Ele não permite excluir o arquivo executável e as DLLs porque o Windows mapeia partes dos arquivos executáveis na memória como parte da criação do processo, portanto, ele precisa do arquivo durante a vida útil do processo.
Infelizmente, não tenho uma razão verdadeira para permitir a renomeação desses arquivos. Eu acho que isso é feito para permitir a atualização dos arquivos dlls e exe enquanto eles estão sendo executados para minimizar o tempo de interrupção do serviço.
O linux (unix em geral) em contraste permite excluir um arquivo executável enquanto ele está em execução:
tmp]$ cp /usr/bin/md5sum .;ll md5*; \
(./md5sum /home/pub/iso/FC5/FC-5-i386-DVD.iso & ); \
rm md5sum ; ll md5*;ps -f
-rwxr-xr-x 1 sergey sergey 37276 Oct 16 02:38 md5sum
ls: cannot access md5*: No such file or directory
UID PID PPID C STIME TTY TIME CMD
sergey 2423 2422 0 02:32 pts/1 00:00:00 -bash
sergey 2533 1 0 02:38 pts/1 00:00:00 ./md5sum /home/pub/iso/FC5/FC-5-
sergey 2536 2423 0 02:38 pts/1 00:00:00 ps -f