A adição de duas fontes de som idênticas aumentará o nível de potência sonora total com 3dB ( fonte )
Então, sim, dois ventiladores a meia velocidade mudam a mesma quantidade de ar com muito menos ruído. Isso (com pequenas variações) será verdadeiro para todos os fãs.
Qualquer questão de ressonância de casos é pura especulação, pois varia em uma base caso a caso (trocadilho intencional). Duvido que seja um problema.