Nossos numerosos clientes nos ligaram com o mesmo problema. O Skype para Mac não possui uma configuração para desativar a confirmação de logoff. Eu tentei o mais recente Skype a partir de hoje, versão 5.3.0.1093, em nosso desenvolvimento Mac e Skype tem o mesmo problema lá - impede Mac de desligar.
By the way, o mais recente Skype para Windows tem um problema semelhante no Windows XP, Vista e Windows 7. Ele não pode impedir que o Windows desligue, mas ele trava eo Windows tem que forçá-lo a fechar ao desligar.
Uma maneira de lidar com isso é desativar TODAS as notificações, se você preferir viver sem nenhuma delas, do que ter esse incômodo com o Skype, impedindo que você desligue seu Mac sem a intervenção do usuário:
Inicie o Skype, vá até o menu de arquivos Skype , depois Preferências , depois Notificação e marque a opção "Desativar todas as notificações visuais " caixa de seleção.