Sim, é possível.
Primeiro, reproduza seu vídeo para ver se está tudo bem:
ffplay -i YourMovie.mp4 -vf "cropdetect=24:16:0"
Os valores do filtro cropdetect
são:
cropdetect=limit:round:reset
limit = black threshold (default 24)
round = output resolution must be divisible to this
reset = after how many frames the detection process will start over
Se tudo der certo, corte:
ffmpeg -i YourMovie.mp4 -vf "crop=640:256:0:36" YourCroppedMovie.mp4
Fonte e mais informações: René Calles blog renevolution.com