Primeiro, edite wincmd.ini, procure UseIniInProgramDir=
e defina como 7.
UseIniInProgramDir=Flags sum This variable will only be read if the wincmd.ini is located in the same dir as the program. It is the sum of the following values : 0: Disabled 1: Use wincmd.ini in the program-dir. if no other location is set via the registry or parameters 2: Use wcx_ftp.ini in the program-dir. if no other location is set via the registry or parameters 4: Override the registry settings (but not the command line parameters)
Em seguida, edite o atalho para o Total Commander para que fique assim:
TC_path\TOTALCMD.EXE /i=config_path/wincmd.ini
Onde TC_path é o caminho para o totalcmd.exe e config_path é o caminho desejado para o wincmd.ini