Como você copiou todos os arquivos necessários para boot/efi/EFI/Microsoft/Boot , é necessário reconstruir a configuração do Windows Loader. Você vai precisar de um usb inicializável do Windows ou DVD (64 bits será preferível).
1: Inicialize a partir do seu meio inicializável. Certifique-se de estar inicializando no modo UEFI.
2: Na primeira tela (onde pede para você escolher o idioma e o teclado), pressione Shift + F10 . Isto lhe dará um prompt de comando.
3: Digite diskpart e, em seguida, list disk (para listar todos os discos disponíveis). Selecione o disco rígido apropriado digitando select disk # .
4: Agora digite list partition e certifique-se de que haja uma partição do tipo system (a partição efi). Selecione esta partição digitando select partition # e atribua uma letra de unidade temporária a ela, digamos G digitando assign letter=G .
5: Apenas para garantir que a letra da unidade esteja atribuída corretamente, digite list vol . Você deve ver um volume com drive letter (Ltr) as G & file system (Fs) as FAT32
6: Feche diskpart digitando exit. Certifique-se de estar em X:\Sources .
7: Digite cd /d G:\EFI\Microsoft\Boot\ . Agora execute esses comandos um por um.
bootrec /scanos bootrec /fixmbr bootrec /fixboot bootrec /rebuildbcd bcdboot C:\Windows /l en-us /s G: /f ALL
8: Feche o prompt de comando e reinicie o sistema. Agora você deve estar inicializando no Windows.
9: Claro que você pode ou não ter o menu grub agora. Mas instalar o grub é muito mais fácil. Siga qualquer um desses links para mais informações.
EDITAR - Certifique-se de remover a letra de unidade G atribuída à partição efi o mais rápido possível para evitar que apareça em Meu computador.