Apenas certifique-se de que, ao colar para o vim, o modo de inserção esteja ativado. Faça isso pressionando i antes de colar.
Caso contrário, caracteres colados como i ou o acionam o modo de inserção e você perderá tudo antes.
Quando copio texto de um aplicativo GUI do OS X (por exemplo, Firefox) e o colo no vim no meu terminal, muitas vezes faltam as primeiras linhas ou caracteres, sem nenhum padrão óbvio.
Isso pode não ser específico do vim, mas eu testei apenas colando no terminal quando não estou usando o vim - por exemplo. ao usar o bash shell - e não tenha problema.