Por fim, substituí o cartão e agora tudo está funcionando. Várias tentativas de excluir os arquivos através de sistemas diferentes falharam. Depois de mais pesquisas, parece que alguns cartões SD / memória flash são capazes de alterar uma parte com falha do cartão para somente leitura, o que permite que a parte gravável ainda aceite as alterações, embora não permita que nenhum dos itens antigos seja alterado. Como o dispositivo já estava cheio, é praticamente inútil como algo mais que um backup permanente. Obrigado pelo conselho de todos.