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Por quê?
Na verdade, o início de um HDD é mais rápido do que o fim (os SSDs são animais completamente diferentes) e, quando você precisa trocar, você quer que ele seja o mais rápido possível.Você deseja que seus aplicativos, arquivos temporários, ... iniciem o mais rápido possível para ter uma boa experiência do usuário.
(Para completar: Se você estiver executando um servidor de banco de dados, coloque os bancos de dados entre 1 e 2)
Dica gratuita adicional : não compre apenas um novo HD interno, compre 2: um extra para fazer cópias de segurança! Leia as perguntas e respostas para mais informações ! ; -)