Provavelmente tem um nome que você simplesmente não consegue ver.
Teste dir /x
Exibe os nomes abreviados gerados para nomes de arquivos não 8dot3. O formato é de / N com o nome abreviado inserido antes do nome longo. Se nenhum nome abreviado estiver presente, os espaços em branco serão exibidos em seu lugar.
Mais informações, digite help dir
ou aqui
Então, quando você tiver esse nome, use o comando rmdir
ou rd
para excluir o diretório. (Ou del
se for um arquivo invisível)