mutt
é um MUA interativo, sem recursos de filtragem automática. Sua melhor escolha seria encontrar (ou escrever) um cliente IMAP gravável.
Às vezes, os servidores de e-mail também têm uma interface da Web com recursos de edição de filtro ou o protocolo ManageSieve.
Ou muito feio, mas factível:
- ponha mensagens no seu próprio computador usando o fetchmail / getmail / offlineimap
- filtre por procmail / maildrop / peneira
- armazene em seu próprio servidor IMAP, ou faça o upload usando o offlineimap.