Quando o núcleo é estrangulado, isso significa que ele é desacelerado (tensão baixa, freqüência reduzida) para reduzir o calor gerado (o calor provém da energia e a energia é proporcional ao quadrado da freqüência). Eu estou supondo que o estrangulamento da embalagem significa que a peça de silicone em que o núcleo foi colocado está superaquecendo (e não o núcleo em si) e assim mais uma vez a voltagem foi diminuída.
Isso certamente tem um impacto negativo no desempenho.
Formas de evitar são (a) não rodar tais aplicações pesadas de computação (pelo menos não todas de uma vez), (b) verificar se seus mecanismos de resfriamento (ventiladores etc) estão funcionando e (c) operar sua máquina em um refrigerador meio Ambiente. É possível que nada disso seja factível / consertado / quebrado no seu caso.