Parece que é um problema com a extensão git-cheetah com o git 1.9.0.
A recent change made for FarManager makes Git Cheetah capture stderr/stdout even when we are not interested in it, to avoid cluttering FarManager's precious console. Due to this workaround, Git Bash makes the Explorer -- Git Cheetah's primary intended consumer -- hang.
Parece que a correção foi confirmada no codebase, mas quando ela aparecerá na atualização do git, não tenho idéia!