O motivo pelo qual o seu teclado está abrindo o gnome-terminal em vez do terminator é porque o atalho do teclado é mapeado explicitamente para o gnome-terminal e não para o terminal padrão.
Assim, você pode tentar remapear o atalho de teclado para apontar para o terminador em vez do gnome-terminal.
Pesquise Teclado na visão geral do painel e vá para a guia Atalhos . Em seguida, vá para Atalhos personalizados e adicione uma nova entrada com o comando apontando para x-terminal-emulator
e reatribuindo o atalho para Ctrl + Alt + T .