Acho que isso é um erro . Se você pudesse mover o painel do shell, veria que o menu passaria por toda a tela e forneceria Arquivo / Editar / Visualizar / Ir / Marcadores / Ajuda.
É causada pelos hacks que a Unity precisa fazer para obter um menu para a área de trabalho. Sim, eu sei que você não está usando o Unity. Nem eu (Gnome Classic) e eu também tenho isso.
Infelizmente, a única maneira de ser corrigido é se alguém melhorar o modo como o Unity lida com os menus, ou eles elaboram o hack para que ele só funcione quando o Unity estiver em execução.Existem patches por aí (confira o relatório do bug), mas não sei dizer se ou quando será puxado.