Eu acho que a resposta é não porque um atalho não é realmente um link simbólico da mesma maneira que no linux. O conceito de link simbólico foi introduzido como parte do NTFS 5.0, mas eles se aplicam a diretórios, não a arquivos. As coisas podem ter mudado no Windows 7, eu admito estar sem noção lá. Shell-shocked tem um bom artigo sobre o Windows Simbólico e Hard Links.
Seria legal ser provado errado neste, porque este é um problema que eu adoraria ter uma solução no trabalho!